我们一开始就要认定，既然他是神，而我们是被他所造的人，就一定会有一些不蒙应允的祷告。这是因为神将他为未来所作的智慧计划隐藏起来了，因此纵然有人祷告，许多事件在神命定的时间来到以前是不会发生的。犹太人为弥赛亚的降临祷告祈求了几个世纪，虽然他们的祷告是对的，但要“及至时候满足”了，神才“差遣他的儿子”来到世上（加4：4）。殉道者在天上的灵魂，脱离了罪而得自由，他们大声呼求神审判地上的人（启6：10），但神没有立刻答应，而是告诉他们要安息片时（启6：11）。很清楚地，许多祷告会有很长的时期得不到回应，因为祷告的人并不知道神所智慧安排的时间。

我们祷告得不到应允，也可能是因为我们不一定知道如何按照该祷告的内容来祷告（罗8：26），或不一定都是按照神的旨意来祷告（雅4：3），或不一定都是以信心来祈求（雅1：6-8）。有时候我们以为某一个解答是最好的，殊不知神有更好的计划，甚至是透过苦难和艰难来达成他的目的。无疑地，约瑟一定曾迫切地祷告，求神将他从深坑和从被卖到埃及为奴的光景下拯救出来（创37：23-36），不过等了许多以后，他才发现在所有这些事件中，“神的意思原是好的”（创50：20）。

当我们的祷告不蒙应允时，我们是与耶稣为伴，因为他这样祷告：“父啊，你若愿意，就把这杯撤去；然而不要成就我的意思，只要成就你的意思。”（路22：42）我们也是与保罗为伴，因为他向主祷告“三次”，求主除去他身上的刺；但是主没有那样做，反而对他说：“我的恩典够你用的，因为我的能力在人的软弱上显得完全。”（林后12：8-9）我们也是与大卫为伴，因为他祷告神拯救他儿子的性命，但是神没有那样做，所以他就“进耶和华的殿敬拜”，并且这样地说到他的儿子：“我必往他那里去，他却不能回我这里来。”（撒下12：20，23）我们也是与历史上殉道者为伴，因为他们曾祷告祈求得着释放，但却没有成就；他们“虽至于死，也不爱惜性命”（启12：11）。

当我们的祷告得不到答应时，我们必须继续信靠那一位使“万事都互相效力”的神（罗8：28），并将我们的忧虑卸给他，因为他一直都顾念我们（彼前5：7）。我们必须持续地记住，他会赐下足够的力量，使我们度过每一天（申33：25）；他也应许我们说：“我必不撇下你，也不丢弃你。”（来13：5；另参罗8：35-39）

我们也必须继续祷告。有时候经过漫长的等待，神突然答应了我们的祷告，就像哈拿求子多年以后生下撒母耳（撒上1：19-20），或像西面亲眼看见了盼望已久的弥赛亚进入圣殿（路2：25-35）。

然而有时候我们的祷告在今生得不到应允。有时神要到我们死后才答应那些祷告，而有时神就是不答应那些祷告；然而那些祷告所表达出来的信心，以及对神和对他所造之百姓的爱，仍然上升到神的宝座之前，成为神所喜悦的馨香之祭（启5：8；8：3-4），并且至终这些祷告的人将“在耶稣基督显现的时候，得着称赞、荣耀、尊贵”（彼前1：7）。